灵谷寺原为明代所建的金陵名刹，是宝志禅师的应化真身道场，现在寺内院落共有三重，西首为大雄宝殿，宝殿正中释迦牟尼塑像，左右为观音菩萨和地藏菩萨，殿两侧排列十八尊罗汉，东首院落原为观间殿，后改为玄奘法师纪念堂。灵谷寺位于中山陵东，是紫金山风景最胜之区。
灵谷寺原名开善寺，南朝梁天监十三年（514）梁武帝萧衍为葬其师宝志和尚所建。内葬名僧宝志和尚遗骨，造有志公塔，唐代更名宝公禅院，南唐改称开善道场，北宋称太平兴国寺，明初改名蒋山寺。此寺原来修建在紫金山独龙阜，即现在的明孝陵所在地。明洪武十四年（1318），明太祖朱元璋为在独龙阜建明孝陵，将寺和塔迁此，并改名灵谷寺。当时规模很大，占地500余亩，山门上书“天下第一禅林”，后毁于兵烫。现在的灵谷寺是1928年至1935年在原寺址建成的国民革命军阵亡将士公墓。建国后改名为灵谷公园，但习惯上仍称灵谷寺。
灵谷寺大门是一座三拱门的门厅，上覆绿色琉璃瓦，两侧是红墙。中门上题“灵谷胜境”，两侧偏门各书“松声”、“泉涛”。大门正南有一个长近百米的月牙形放生池，又称万工池，相传是朱元璋调用万名军工挖掘而成。进大门，过雨道是无梁殿。无梁殿原名无量殿，因供奉无量佛而得名，是原灵谷寺仅存的一座建筑，因整座建筑全用砖石砌成，无梁无椽，所以又称无梁殿。殿高22米，宽46.7米，进深37.9米，南北各有3个拱门，四面皆有窗。结构坚固，气势雄伟，至今已有600多年历史。几百年来，历经沧桑，仍完好无损。有人认为，在我国现存的几座无量殿(无梁殿)中，以灵谷寺的无量殿气势最雄伟，是我国古代石建筑的杰作。殿前有一座五楹带顶的阵亡将士牌坊，中间坊额书“大仁大义”，背面刻“救国救民”。坊前置一对汉白玉雕成的貔貅。殿内墙上书刻孙中山的《总理遗嘱》，还书刻国民革命阵亡将士名单。无梁殿后是阵亡将士第一公墓，此墓连同位于东西各300米处的第二、第三公墓共埋葬北伐与抗日阵亡将士1029名，弧形墓墙后是松风阁，建于几十级台阶之上，阁高10米，宽41.7米，九楹二层，外有回廊，四周红柱环绕，二楼为中空式，顶覆绿色琉璃瓦，蓝色披檐。阁后甬道正中置宝鼎一座。上刻“名鼎垂勋”四字。
由此向北约百米就是灵谷寺的标志性景点灵谷塔，塔高66米，九层八面，底层直径14米，顶层直径9米，为花岗石和钢筋混凝土混合结构。1933年建成，当时称阵亡将士纪念塔，俗称九层塔。塔内有螺旋式台阶绕中心石柱而上，计252级，每层均以蓝色琉璃瓦披檐，塔外是一圈走廊，廊沿有石栏围护，供游人凭栏远眺。无梁殿东有灵谷寺，寺内大雄宝殿供如来佛；大道觉堂供玄奖法师灵骨；观音宝阁供观音菩萨；还有藏经楼、弥勒殿、祖堂等建筑。寺门对面是一座带顶的黄色照壁。寺东有座品质碑，碑高约5米，上刻“灵谷深松”四字。由流觞厅向东南不足百米即至邓演达墓。墓门正中是一座圆形花坛。两侧有露天游廊左右环抱，廊上架有水泥条架、植紫藤为篷；游廊尽头各有方亭一座。墓前雪松、龙柏，地下铺草坪，东、西、北三面有石墙环绕。墓前有花岗石墓碑，刻何香凝所书“邓演达烈士之墓”，墓圆形，筑于平台上，高4.5米、直径9.5米，为省文物保护单位。
灵谷寺地处紫金山东南麓，为明代佛教三大寺院之一。紫金山早在六朝时就已是佛教圣地，梁武帝时，其周围大小寺院已达70多所。到了明代，这些寺院历经沧桑，大部分被毁，只有南麓独龙岗一带的蒋山寺、定林寺、宋熙寺等少数几座保存完好。灵谷寺前身就是处于独龙岗的开善寺，南朝天监十三年（514年）梁武帝为埋葬宝志和尚，在独龙岗建开善精舍和志公塔。唐代改称宝公院，北宋大中祥符年间，改称太平兴国禅寺，明初改为蒋山寺。朱元璋为建明孝陵，命人选中独龙岗这块风水宝地，于是就下令将这一带包括蒋山寺在内的所有寺院都迁往紫金山东麓，合为一寺。因为灵谷寺的地形是“左群山右峻岭”之间的一片谷地，所以命名为“灵谷寺”。灵谷寺初建时，规模宏大，殿宇林立，佛塔矗立，从山门到大殿，长2.5公里，占地约500亩，僧1000余人。除现存外，当时还有金刚殿、天王殿、五方殿、毗卢殿、观音阁、禅堂、客室、方丈室等。
清代中叶的灵谷寺，又恢复了昔日的盛貌。除殿宇修复外，并有“灵各八景”著称。这八景是：钟阜晴云，浮图秋月，古殿钟声，苍池松影，银杏栖霞，清泉咽竹，空衍应掌，曲水流筋。朱元璋曾御笔题额“第一禅林”。可惜后来因遭兵火劫难，只有无梁殿得以幸存。到清同治年间重修灵谷寺，规模已远不如当年，然而红墙黄瓦、松翠林茂、鸟语花香、环境幽静，仍不失“灵谷深秋”的佳景。现在寺内院落共有三重，西首为大雄宝殿，宝殿正中释迦牟尼塑像，左右为观音菩萨和地藏菩萨，殿两侧排列十八尊罗汉，东首院落原为观间殿，后改为玄奘法师纪念堂。
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